Если щен крупный, т.е. не подходит для перевозки в салоне по габаритам, то ничего не поменяется: его заберут в багаж прямо со стойки регистрации.
я про грузовые перевозки писала, а не про перелет вместе с человеком.
поменяется очень многое.
до погрузки на борт собака может находиться около двух часов, где угодно - на холодном складе свх или вообще прямо на улице на открытом воздухе (были случаи). отчего собакин и может потом заболеть.